Si bien los pueblos kampong y los senderos para bicicletas de la isla atraen a las multitudes de fin de semana, sus canales de manglares poco profundos y bahías protegidas siguen siendo mejor explorados en kayak. La costa occidental, frente al continente, ofrece aguas tranquilas ideales para palistas novatos. Los humedales orientales de Chek Jawa, una llanura intermareal de 100 hectáreas designada como área de conservación en 2001, revelan lechos de pastos marinos y llanuras de lodo con la marea baja, accesibles solo por agua o por el paseo marítimo costero.
Las rutas de kayak en Pulau Ubin se dividen en tres zonas. La ruta norte sigue el arroyo rodeado de manglares de Sungei Jelutong, donde las raíces de Bruguiera cylindrica y Avicennia alba crean arcos naturales con la marea alta. La ruta se extiende tres kilómetros río arriba antes de que el canal se estreche más allá de la capacidad de remado. El circuito costero sur bordea las canteras de granito abandonadas inundadas en la década de 1970, con paredes rocosas que caen seis metros hacia aguas turquesas. Los operadores de alquiler de kayaks de Pulau Ubin se encuentran en el muelle principal cerca de Ubin Town, el único centro comercial de la isla, donde el ferry de Changi Point deja a los visitantes cada 20 minutos desde las 06:00 en adelante.
La zona intermareal de Chek Jawa, el hábitat marino más rico de Singapur, alberga más de 100 especies de pastos marinos, moluscos y crustáceos. Los kayakistas que cronometran su llegada dos horas antes de la marea baja pueden remar a través de las llanuras poco profundas, observando estrellas de mar y cangrejos herradura a través del agua clara. El paseo marítimo de manglares, terminado en 2007, ofrece un punto de vista elevado, pero revela poco de los ecosistemas del canal, visibles solo desde el nivel del agua. Las excursiones en kayak por los manglares de Pulau Ubin, que suelen durar de dos a tres horas, navegan cambios de marea que pueden dejar kayaks varados en llanuras de lodo expuestas si se calculan mal.
La industria del granito de la isla, que empleó a 3.000 trabajadores de canteras hasta la década de 1970, dejó pozos inundados ahora colonizados por vegetación costera. Estas canteras crean lagunas protegidas donde los entusiastas de la pesca en kayak en Pulau Ubin buscan lubinas y meros en aguas de cinco a ocho metros de profundidad. El granito en sí, formado hace 200 millones de años durante el período Triásico, aflora a lo largo de la costa este en rocas suaves y redondeadas formadas por milenios de acción de las olas. Ninguna embarcación motorizada opera en las zonas de conservación, dejando a los kayakistas solos con las corrientes de marea y el sonido del agua moviéndose a través de las raíces de los manglares.
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