Mentre i villaggi kampong e i sentieri per biciclette dell'isola attirano folle nel fine settimana, i suoi canali di mangrovie poco profondi e le baie riparate rimangono meglio esplorabili in kayak. La costa occidentale, affacciata sulla terraferma, offre acque calme ideali per i principianti. Le zone umide orientali di Chek Jawa, una distesa intertidale di 100 ettari designata come area di conservazione nel 2001, rivelano letti di alghe esposti e distese fangose durante la bassa marea, accessibili solo via acqua o tramite la passerella costiera.
I percorsi in kayak a Pulau Ubin si dividono in tre zone. Il percorso settentrionale segue il torrente fiancheggiato da mangrovie di Sungei Jelutong, dove le radici di Bruguiera cylindrica e Avicennia alba creano archi naturali con l'alta marea. Il percorso si estende per tre chilometri a monte prima che il canale si restringa oltre lo spazio di manovra della pagaia. Il circuito costiero meridionale costeggia cave di granito abbandonate allagate negli anni '70, le cui pareti rocciose scendono per sei metri in acque turchesi. Gli operatori di noleggio kayak di Pulau Ubin si trovano al molo principale vicino a Ubin Town, l'unico centro commerciale dell'isola, dove il traghetto di Changi Point deposita i visitatori ogni 20 minuti a partire dalle 06:00.
La zona intertidale di Chek Jawa, l'habitat marino più ricco di Singapore, ospita oltre 100 specie di alghe, molluschi e crostacei. I canoisti che pianificano il loro arrivo due ore prima della bassa marea possono pagaiare attraverso le secche, osservando stelle marine bitorzolute e limuli attraverso l'acqua limpida. La passerella delle mangrovie, completata nel 2007, offre un punto di osservazione elevato ma rivela poco degli ecosistemi dei canali visibili solo dal livello dell'acqua. I tour in kayak tra le mangrovie di Pulau Ubin, solitamente di due o tre ore, navigano tra spostamenti di marea che possono far incagliare i kayak su distese fangose esposte se valutati male.
L'industria del granito dell'isola, che impiegava 3.000 lavoratori nelle cave fino agli anni '70, ha lasciato dietro di sé pozzi allagati ora colonizzati dalla vegetazione costiera. Queste cave creano lagune riparate dove gli appassionati di kayak fishing a Pulau Ubin puntano al branzino e alla cernia in acque profonde da cinque a otto metri. Il granito stesso, formato 200 milioni di anni fa durante il periodo Triassico, affiora lungo la costa orientale in massi lisci e arrotondati modellati da millenni di azione delle onde. Nessuna imbarcazione a motore opera nelle zone di conservazione, lasciando i canoisti soli con le correnti di marea e il suono dell'acqua che si muove attraverso le radici delle mangrovie.
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